От ноември 2008 година официалните дилъри на марката Skoda приемат заявки за специалната версия Fabia Sport Edition. Автомобилът е решен в стилен червен цвят с бял покрив; снабден е с двигател 1.6 16V (105 к.с.) с 5-степенна механична скоростна кутия и спортно окачване.
Интериорът на автомобила се отличава от стандартната версия на Fabia по спортните червено-черни седалки Alcantara, хромираните прагове в надпис Fabia и хромираните педали.